越来越多的研究者意识到同步记录眼动和fMRI/MEG数据的重要性。眼动追踪能够监控被试在扫描过程中的任务卷入程度、监控可能的干扰因素（如眼跳和眨眼），并进行高级的数据分析，如注视锁时(FIRE)的fMRI。眼动追踪也让注视关联的刺激呈现成为可能，极大地扩展了研究者可探讨的知觉和认知过程。EyeLink眼动仪是目前较为流行的fMRI和MEG兼容的眼动追踪设备。
EyeLink 1000 Plus是MRI和MEG实验环境下高精准和高采样率的眼动仪；一套设备，两种用途。用户可以采用远距支架及配套的高速图像采集端和红外光源在MRI/MEG环境下使用，用户也可选配其他支架在行为实验室使用。该设备适用于影像实验室的其他特性包括：
兼容所有主要的MRI和MEG设备；
兼容多种头线圈；
安装简便，用户可快速完成被试设置；
采样率高达2000 Hz（单眼），追踪误差低于0.5°；
镜头距眼睛的距离在60到150 cm之间；
追踪视野达32° x 25°视角；
可选配940 nm红外光源，适用于暗适应环境；
提供托盘支架和屏幕支架等多种支架，可与各种刺激屏幕搭配使用；
提供模拟信号输出，可与MEG数据无缝同步记录。
SR Research Experiment Builder让研究者能够快速开发实验任务，并支持多种fMRI相关的触发，便于刺激呈现和扫描周期同步。该软件具有众多适用于fMRI/MEG研究的特性。
提供数百种试验任务模板，比如视觉搜索、点探测、变化视盲、线索任务等；
以毫秒级的计时精度呈现文本、图片、视频和音频等刺激；
MRI的TR脉冲可以用以控制实验进程并允许眼动和fMRI数据同步；
以毫秒级的计时精度记录反应按键和声音键触发；
内置眼跳、注视、速度、边界等触发功能，便于快速开发需要实时眼数据的实验任务；
支持与MRI/MEG及多种其他数据采集设备同步记录。
除了Experiment Builder，用户还可以给自己采用E-Prime、Psychtoolbox、Presentation等第三方软件编写的实验任务快速添加眼动追踪功能。
